El queso cheddar obtiene su color a partir de un pigmento natural de origen vegetal llamado annatto. El annatto se extrae de las semillas del árbol de achiote, que es originario de las regiones tropicales de Centro y Sudamérica.
El annatto se agrega a menudo al queso como agente colorante para darle un color naranja más apetitoso y consistente. Sin embargo, no todos los quesos cheddar son de color naranja. Algunos quesos cheddar pueden tener un color blanco o amarillo, según la calidad y cantidad de annatto utilizado, o si ha sido envejecido durante un período más largo.
Además, algunos productores de queso cheddar pueden optar por no utilizar annatto en absoluto, especialmente aquellos que se centran en la producción de variedades de queso tradicionales o artesanales.